Según la Ley 939 de 2004, el biohidrógeno se clasifica como un biocombustible, siendo este "Hidrógeno producido de biomasa y/o residuos biodegradables". Este reconocimiento legal abre la posibilidad de beneficiarse de exenciones fiscales, siempre que se respete la normativa vigente. Además, se hace referencia a la Ley 2099 de 2021, que otorga beneficios tributarios específicos para el hidrógeno verde y azul, sugiriendo que se debe solicitar certificación de la UPME para disfrutar de tales incentivos.